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當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術(shù)服務(wù)>>蛋白分析>> Edman降解如何實現(xiàn)N端蛋白質(zhì)測序?步
產(chǎn)品型號
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時間:2025-06-15 13:34:36瀏覽次數(shù):61次
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Edman降解如何實現(xiàn)N端dànbáizhì測序?Edman降解的核心原理是基于N端氨基酸的化學(xué)選擇性降解,通過環(huán)化裂解逐步去除dànbáizhìN端的氨基酸,并以穩(wěn)定的衍生物形式進行檢測。該方法基于化學(xué)反應(yīng),利用異硫氰酸苯酯(PITC)特異性地與N端氨基酸結(jié)合,通過逐級切除并鑒定多肽鏈N端的氨基酸,實現(xiàn)N端dànbáizhì測序。Edman降解其核心步驟分為偶聯(lián)、裂解、轉(zhuǎn)化與檢測,循環(huán)重復(fù)直至目標序列解析完成。以下為詳細步驟及機制解析:
一、Edman降解的詳細實驗步驟
1、樣品準備
(1)dànbáizhì純化:確保蛋白樣品高純度,以減少背景噪聲。
(2)固定化處理:通常使用玻璃纖維膜或PVDF膜固定樣品,以提高降解穩(wěn)定性。
(3)檢查N端封閉情況:確保dànbáizhìN端沒有乙酰化、甲基化等修飾,否則Edman降解無法進行。
2、反應(yīng)流程
(1)PITC標記:在堿性緩沖液(如三乙胺)中加入PITC,使其與N端氨基結(jié)合。
(2)酸性裂解:用三fúyǐsuān(TFA)促進環(huán)化反應(yīng),使PTH-氨基酸從肽鏈中斷裂。
(3)有機溶劑萃取:用有機溶劑萃取生成的PTH-氨基酸,以便進行檢測。
3、PTH-氨基酸鑒定
采用高效液相色譜(HPLC)進行分離分析。通過與標準PTH-氨基酸對照,確定具體的氨基酸種類。
4、重復(fù)循環(huán)
清洗反應(yīng)體系,去除殘余PTH-氨基酸。繼續(xù)降解下一個氨基酸,直至實現(xiàn)完整N端dànbáizhì測序。
二、Edman降解的機制解析
1、選擇性化學(xué)反應(yīng)
PITC能夠特異性地與N端氨基酸發(fā)生反應(yīng),而不會影響dànbáizhì內(nèi)部的肽鍵。
2、溫和的降解條件
相比其他化學(xué)降解方法(如水解法),Edman降解的條件較溫和,避免了dànbáizhì或多肽的整體破壞。
3、高效的環(huán)化裂解
通過酸性環(huán)境誘導(dǎo)環(huán)化反應(yīng),使N端氨基酸高效釋放,同時肽鏈的其余部分保持完整。
4、穩(wěn)定的PTH-氨基酸分析
PTH-氨基酸具有穩(wěn)定的光學(xué)特性,能夠通過HPLC等方法準確檢測。
三、Edman降解的優(yōu)點與局限
1、優(yōu)點:
(1)高專一性識別N端序列,無需數(shù)據(jù)庫比對
(2)可用于確認蛋白翻譯起始位點或標簽序列
(3)對于小肽、合成肽、修飾蛋白等提供準確N端結(jié)構(gòu)驗證
2、局限:
(1)需高純度、均一性蛋白樣品(雜質(zhì)影響明顯)
(2)無法解析有N端阻斷(如乙酰化、修飾)的蛋白
(3)序列過長或樣品復(fù)雜度高時通量低
(4)對翻譯后修飾識別能力有限
Edman降解通過化學(xué)反應(yīng)的jīngzhǔn級聯(lián),實現(xiàn)了N端氨基酸的逐級解析。盡管面臨通量低、長度受限等挑戰(zhàn),其在短肽測序、N端修飾檢測及法規(guī)質(zhì)控中的bùkětìdài性,使其在現(xiàn)代dànbáizhì科學(xué)中仍占有一席之地。未來,與質(zhì)譜、微流控及人工智能的深度融合,或?qū)檫@一經(jīng)典技術(shù)注入新的活力。百泰派克生物科技7大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式基于Edman降解的蛋白N端序列分析服務(wù)需求,致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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百泰派克生物科技配備自動化Edman降解儀與高靈敏HPLC系統(tǒng),結(jié)合質(zhì)譜測序數(shù)據(jù),為客戶提供N端結(jié)構(gòu)驗證 + 全長dànbáizhì測序的整合解決方案,適配科研藥物研發(fā)需求。如果您正面臨蛋白N端結(jié)構(gòu)驗證或標簽表達困擾,歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技,獲取zhuānyè、快速、定制化的測序服務(wù)支持!
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。
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2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
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百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。
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1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白
采用金屬標記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
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