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漲知識 | qPCR專場五:如何分析熒光定量數據?
熒光定量PCR實驗因為靈敏度高所以經常是差之毫厘謬以千里,所以在實驗過程中,我們需要注意諸多細節,謹慎操作。小伙伴們看到這里就要著急了,我怎樣才能做好qPCR實驗,拿到實驗結果,發表高分文章,走上人生呢?
線性范圍和靈敏度驗證:檢測線性范圍中的最高點和點濃度;
模板質量驗證:分光光度計分析260/280、260/230比值;
數據精度驗證:重復組內的Ct值差距應≤0.5;
擴增效率驗證:斜率盡可能接近-3.3,相當于擴增效率盡可能接近100%,測試前后斜率盡可能一致。
內參基因通常是一種始終保持著低水平甲基化且一致處于活性轉錄狀態的基因,高度保守且在大多數情況下持續表達,其表達水平受環境因素影響較小。通常在檢測基因的表達水平時用作參照物,校正操作、上樣量差異等帶來的實驗誤差,從而保證結果的準確性。
理論狀態下,PCR擴增呈現指數增長,每次循環增加一倍的量,用數學表示,則為2的Ct次方。當產物量到達同一水平,但對應的Ct值不同,其原因在于初始的模板量差異。將其做比,可了解他們的模板量的差異,如下:
方法 | 分類 | 產品名稱 | 貨號 |
RNA提取 | 同Trizol提取 | TRIeasy™ Total RNA Extraction Reagent | 10606ES |
動物組織/細胞總RNA提取,避開有毒試劑,最快15 min完成 | MolPure® Cell/Tissue Total RNA Kit細胞/組織總RNA提取試劑盒 | 19221ES | |
簡單植物總RNA提取,避開有毒試劑,最快40min完成 | MolPure® Plant RNA Kit 植物RNA提取試劑盒 | 19291ES | |
多糖多酚植物總RNA提取,最快30min完成 | MolPure® Plant Plus RNA Kit 多糖多酚植物RNA提取試劑盒 | 19292ES | |
細胞總RNA提取,避開有毒試劑,最快8 min完成 | MolPure® Cell RNA Kit 培養細胞RNA提取試劑盒 | 19231ES | |
qPCR染料法 | 高靈敏通用型定量預混液(染料法) | Hieff UNICON® Universal Blue qPCR SYBR Master Mix | 11184ES |
定量預混液 (染料法),已發文章累計IF達到5000+ | Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox) | 11201ES | |
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (Low Rox) | 11202ES | ||
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (High Rox) | 11203ES | ||
高靈敏型qPCR預混液(染料法) | Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox) | 11198ES | |
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix (Low Rox) | 11199ES | ||
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix (High Rox) | 11200ES | ||
miRNA加A法高特異性定量預混液(染料法) | Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix(加A法) | 11171ES | |
miRNA莖環法高特異性定量預混液(染料法) | Hieff® miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix(莖環法) | 11170ES | |
高靈敏一步法反轉定量試劑盒(染料法) | Hifair® III One Step RT-qPCR SYBR Green Kit | 11143ES | |
細胞直擴RT-qPCR,1.5 h從細胞到基因表達分析(染料法) | Hieff® Fast Cell Direct SYBR Green RT-qPCR Kit | 11172ES | |
反轉錄試劑 | 5 min快速反轉,最長可滿足14 kb cDNA合成,含gDNA去除(下游應用PCR/qPCR)-示蹤版New | Hifair® AdvanceFast 1st Strand cDNA Synthesis Kit | 11149ES |
5 min快速反轉,最長可滿足14 kb cDNA合成,含gDNA去除(下游應用PCR/qPCR)-常規版New | Hifair® AdvanceFast 1st Strand cDNA Synthesis Kit(No Dye) | 11150ES | |
15 min一步完成gDNA去除與反轉錄(下游應用qPCR) | Hifair® V one-step RT-gDNA digestion SuperMix for qPCR | 11142ES | |
鏈cDNA合成預混液,含gDNA去除(下游應用qPCR) | Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (gDNA digester plus) | 11141ES | |
最長可滿足19.8 kb cDNA合成試劑盒,含gDNA去除(下游應用PCR/qPCR) | Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus) | 11139ES | |
常規30 min反轉預混液,含gDNA去除(下游應用qPCR) | Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (gDNA digester plus) | 11123ES | |
miRNA反轉錄試劑盒(加A法) | Hifair® miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (加A法) | 11148ES |