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干貨│酶切實驗的這些坑,你肯定遇到過!

2023-9-12  閱讀(325)

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分子克隆作為分子生物學的一項成熟技術,幾乎每個實驗室都或多或少的會涉及。在分子克隆實驗中,限制性內切酶是克隆產品,但大家也常常因為限制性內切酶的各種問題而感到煩擾。

 

比如小翌常被問到的:


 

1.限制性內切酶種類這么多,不知道如何選擇;

 
2.酶切不完或出現亂切、錯切的情況;
 

3.酶切速度慢,需要1 h甚至過夜酶;

 
4.多酶切還需要選擇多款酶切緩沖液。
 

……

 

針對第1個問題,小翌會簡單介紹一下什么是限制性內切酶,不同內切酶的分類如何,讓您對限制性內切酶有一個更全面的認識。針對第2~4個問題,翌圣 FuniCut® 系列快速內切酶通過菌株改造,配合優化的工藝,可以輕松解決以上難題!

 

 

 
什么是限制性內切酶
 

限制性內切酶是一種能夠識別雙鏈DNA分子中特定核苷酸序列,并在特定位置切割 DNA鏈中的磷酸二酯鍵的一類酶,簡稱限制酶。不同的限制性內切酶會識別不同的DNA 序列,它可以在識別序列內或距識別序列不遠的位置處切割DNA,酶切之后會形成不同類型的產物,如圖1中的BamHI形成5’粘性末端產物,KpnI形成3’粘性末端產物,EcoRV形成平末端產物。

 

圖1. BamHI、KpnI、EcoRV 酶切示意圖

 

限制性內切酶除了于分子克隆實驗中外,它還可以應用于疫苗研發生產、基因測序、SNP鑒定、ddPCR等領域。

 

 

 
限制性內切酶的命名
 

限制性內切酶的命名主要是根據細菌的屬名、種名、菌株或血清型、發現的順序而定,以BstEII為例,命名規則如下表一所示:

 

表1. 限制性內切酶的命名規則

 

 

 
限制性內切酶的分類
 

根據結構的復雜程度、作用方式與輔因子的區別,限制性內切酶可分為四大類,表2總結了各類的特點和典型酶種。

 

表2. 不同限制性內切酶的區別

 

除了以上分類,根據識別和切割位點的異同可以分為3類,如下表3所示:

 

表3. 同裂酶、異裂酶和同尾酶對比

 

針對目前市面上一些限制性內切酶產品需要過夜酶切,花費時間和精力,并且還容易出現酶切產物不正確的情況。翌圣FuniCut®快速限制性內切酶為您排憂解難,通用緩沖液,5 min完成精準酶切,讓您的酶切實驗不再有煩惱!

 

 

 
翌圣FuniCut® 快速內切酶
 
 
產品特點
 
  • 快速酶切:5~15 min完成酶切,較常規酶切實驗可減少1~2 h以上;

  • 通用緩沖液:任意內切酶組合都能用同一緩沖液,多酶切反應更簡便,且兼容進口品牌緩沖液(詳情戳鏈接);
  • 酶切效果:酶切效果同進口品牌N*、T*一致;
  • 直接電泳:提供紅色Color緩沖液,酶切產物可直接點膠電泳,操作更簡便;

  • 精準酶切:即使過夜酶切,星號活性也極低。

 

 

 
數據展示
 
01
在FuniCut® Buffer中,5 min高效完成單、雙和三酶切
 
 

圖2. 5 min高效完成單、雙和三酶切效果圖

 

02
酶切效果媲美N*、T*進口品牌,并且與其buffer兼容性好
 
 

圖3. 與不同品牌buffer兼容的酶切效果圖

 

03
過夜酶切,星號活性極低
 
 

分別使用翌圣、T*、N*品牌的HindIII、NheI、PstI、XbaI、XhoI快速內切酶,以λDNA為底物,按照各品牌推薦的實驗體系,進行過夜酶切(16 h),酶切產物進行瓊脂糖凝膠電泳。瓊脂糖凝膠電泳檢測結果表明翌圣限制性系列產品過夜酶切,表現出超低的星號活性。

圖4. 與不同品牌的限制性內切酶產品過夜酶切效果

 

04

高度冗余,輕松應對一定程度的過量底物

 
 

以 FuniCut® EcoRI、XbaI、SacI快速限制性內切酶,分別以1 μg、1.5 μg質粒為底物,酶切5 min,酶切產物進行瓊脂糖凝膠電泳。瓊脂糖凝膠電泳檢測結果表明翌圣限制性系列產品能輕松處理一定程度的過量底物。

圖5. 分別酶切1、1.5 μg底物的酶切效果圖

 

 

 
客戶反饋
 

客戶分別使用N*品牌和翌圣的BamHI+XbaI對質粒進行雙酶切實驗檢驗,結果表明翌圣限制性內切酶產品效果媲美N*。(來源于上海客戶)

圖6. N*品牌和翌圣的雙酶切效果圖



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