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精彩回顧 | 四企聯(lián)動(dòng),共話(huà)病原快檢——高通量測(cè)序技術(shù)助力病原快檢與防控
8月24日下午,由華大智造、吉因加、金匙醫(yī)學(xué)和翌圣生物聯(lián)合主辦的“四企聯(lián)動(dòng),共話(huà)病原快檢——高通量測(cè)序技術(shù)助力病原快檢與防控"的云聽(tīng)會(huì)落幕,這場(chǎng)齊聚設(shè)備商、服務(wù)商和原料商的研討會(huì),從不同的視覺(jué)角度,為賦能病原領(lǐng)域的診斷和監(jiān)測(cè)等角度提供不同的病原快檢與防控見(jiàn)解,思想的碰撞為大家?guī)?lái)了病原快檢前沿的新設(shè)備、新興技術(shù)和優(yōu)質(zhì)試劑。
DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)加速病原檢測(cè)。華大智造帶來(lái)了全球同等通量測(cè)序儀中速度最快的測(cè)序儀之一-DNBSEQ-G99,在測(cè)序速度和檢測(cè)通量靈活性上,DNBSEQ-G99是一款可以很好的滿(mǎn)足臨床尤其是入院需求的產(chǎn)品,加速序列測(cè)序和病原序列識(shí)別,可實(shí)現(xiàn)9小時(shí)內(nèi)交付。另外靶向測(cè)序平臺(tái)-ATOplex針對(duì)已知病原、混合感染檢測(cè)等實(shí)現(xiàn)一管式檢測(cè)DNA和RNA序列信息。
捕獲tNGS——為臨床微生物檢測(cè)帶來(lái)全新感受的新技術(shù)。吉因加tNGS探針捕獲產(chǎn)品可很好的解答病原檢測(cè)兩大難題-血流感染的病原體診斷攻克低載量DNA檢測(cè)難題和GIN 16-自動(dòng)化建庫(kù)雜交工作站實(shí)現(xiàn)院內(nèi)本地化開(kāi)展可落地的自動(dòng)化設(shè)備和解決方案難題。
tNGS超多重病原檢測(cè)體系構(gòu)建及產(chǎn)品介紹。針對(duì)部分病原基因組差異較大、不同臨床樣本病原體載量差異較大、引物二聚體評(píng)估及引物二聚體去除和污染識(shí)別及污染控制等難題,金匙醫(yī)學(xué)分享了超多重靶向擴(kuò)增技術(shù)對(duì)應(yīng)的解決方案和驗(yàn)證思路,并展示了病原檢測(cè)全流程解決方案。
ZymeEditor酶改造平臺(tái)助力病原精準(zhǔn)診療。翌圣生物以NGS核心酶MMLV的定向改造為例分享了酶定向進(jìn)化核心技術(shù),讓大家感受到酶進(jìn)化的非凡魅力。同時(shí)翌圣ZymeEditor™平臺(tái)自主開(kāi)發(fā)建立的超低殘留去除技術(shù)實(shí)現(xiàn)超低背景菌殘留mNGS酶原料的開(kāi)發(fā)和篩選工作,純化步驟少,產(chǎn)量更高。
Hieff NGS® OnePot Flash DNA Library Prep Kit(Cat#12316)
低起始量兼容:100 pg~50 ng病原DNA樣本均能建庫(kù)成功
極速建庫(kù):片段化5 min、加A 5 min和連接5 min,兼容PCR-free建庫(kù)
背景菌殘留低:大腸等常見(jiàn)工程菌殘留符合要求,試劑較為純凈
兼容雙測(cè)序平臺(tái):提供MGI®、Illumina®建庫(kù)試劑,客戶(hù)按需選擇
表1.12316不同樣本建庫(kù)性能
Hieff NGS® DNA&RNA Library Co-Prep Kit DNA/RNA快速共建庫(kù)方案(Cat#12305)
一管式建庫(kù):DNA&RNA一管式建庫(kù),一步高效完成cDNA合成;
降低建庫(kù)時(shí)間和成本:2.9 h內(nèi)完成共建庫(kù),其中cDNA合成耗時(shí)35 min,酶切法建庫(kù)耗時(shí)2.3 h;
背景菌殘留低:在常見(jiàn)10-100 ng RNA建庫(kù)場(chǎng)景,大腸等常見(jiàn)工程菌殘留符合要求,試劑較為純凈。
表2. 使用共建庫(kù)試劑盒,搭配不同比例的小牛gDNA和293 RNA樣本,2.9 h內(nèi)完成共建庫(kù)
4×Hieff® Multiplex PCR Master Mix For Pathogen 4×病原多重PCR預(yù)混液(Cat#13592)
操作簡(jiǎn)潔:高乘預(yù)混液包含除引物和DNA模板之外所有組分;
性能優(yōu):高均一性、高特異性和高靈敏度,背景殘留低;
兼容廣:兼容GC含量在25%-70%;
兼容多種應(yīng)用場(chǎng)景:tNGS病原微生物檢測(cè)、環(huán)境微生物鑒定和食品安全檢測(cè)等。
表3. 使用zymo病原DNA標(biāo)準(zhǔn)品,分別進(jìn)行酶切建庫(kù)和tNGS多重?cái)U(kuò)增,測(cè)序結(jié)果顯示10種微生物均可有效檢出
交付、高性?xún)r(jià)比,一直是感染性疾病患者的心聲。多款DNA&RNA建庫(kù)試劑盒滿(mǎn)足眾多客戶(hù)的不同需求,助力病原檢測(cè)更精準(zhǔn)、更快捷!
表4. 翌圣病原NGS檢測(cè)產(chǎn)品選擇指南