聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)關(guān)鍵要素詳解
PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是一個(gè)強(qiáng)大的分子生物學(xué)技術(shù),用于擴(kuò)增特定的DNA片段。PCR反應(yīng)指在DNA聚合酶催化下,以母鏈DNA為模板,以特定引物為延伸起點(diǎn),體系中加入dNTP、Mg2+以及延伸因子、擴(kuò)增增強(qiáng)因子,通過(guò)變性、退火、延伸等步驟,體外復(fù)制出與母鏈模板DNA互補(bǔ)的子鏈DNA的過(guò)程,能快速特異地在體外擴(kuò)增任何目的DNA。PCR反應(yīng)將微量目的DNA片段擴(kuò)增一百萬(wàn)以上,它以敏感度高,特異強(qiáng),產(chǎn)率高,重復(fù)好,以快速簡(jiǎn)便優(yōu)點(diǎn)迅速成分子生物學(xué)研究中最為廣泛的方法。
PCR反應(yīng)的成功依賴于五個(gè)關(guān)鍵要素:
1. 引物:
1) 引物是一段短的DNA序列,用于與目標(biāo)DNA模板的特定區(qū)域配對(duì)。
2) 設(shè)計(jì)原則包括長(zhǎng)度(1530 bp)、G+C含量(40%60%)、避免二級(jí)結(jié)構(gòu)和引物間互補(bǔ)等。
3) 通常每條引物的濃度為0.10.5 μmol/L,過(guò)高可能導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。
2. 模板DNA:
是待擴(kuò)增的DNA序列,可以是基因組DNA、cDNA或質(zhì)粒DNA。
數(shù)量和純度對(duì)結(jié)果至關(guān)重要,通常使用102105拷貝,但過(guò)量可能增加非特異性產(chǎn)物。
單鏈和雙鏈DNA均可作為模板,但線性DNA比環(huán)狀DNA擴(kuò)增效果更好。
3. DNA聚合酶:
1) 負(fù)責(zé)催化DNA合成,常用的是Taq DNA聚合酶,因其耐高溫特性。
2) 其他如Pfu、Phusion等酶具有更高保真度,適用于特定應(yīng)用。
3) 酶的濃度通常為1.02.5 U/100 μL反應(yīng)液,過(guò)高或過(guò)低均影響擴(kuò)增效率。
4. dNTPs(脫氧核苷三磷酸):
1) 作為DNA合成的原料,通常等量加入反應(yīng)體系,終濃度為20200 μmol/L。
2) 濃度過(guò)高可能抑制Taq酶活性,影響產(chǎn)物特異性。
5. Mg2+:
1) 作為DNA聚合酶的輔助因子,影響酶活性和產(chǎn)物特異性。
2) 終濃度通常為0.52.5 mmol/L,需要根據(jù)引物Tm值和dNTP濃度調(diào)整。
此外,PCR反應(yīng)還需要緩沖液提供適宜的pH和離子環(huán)境,以及適當(dāng)?shù)臏囟瓤刂疲ㄗ冃浴⑼嘶稹⒀由烊齻€(gè)階段)來(lái)完成循環(huán)擴(kuò)增。
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