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應(yīng)用基因組原位雜交技術(shù)鑒定抗黃矮病小麥新種質(zhì)

來源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2025年05月19日 13:40  

摘要

黃矮病嚴(yán)重威脅小麥生產(chǎn),鑒定抗病新種質(zhì)至關(guān)重要。本研究運(yùn)用基因組原位雜交技術(shù),借助威尼德 HB-500 原位雜交儀,對小麥新種質(zhì)進(jìn)行檢測。成功鑒定出抗黃矮病新種質(zhì),明確其染色體組成及外源染色體來源,為小麥抗病育種提供了優(yōu)異材料與理論依據(jù)。

一、引言

小麥作為全球重要的糧食作物,其產(chǎn)量和品質(zhì)受多種病害影響,黃矮病是其中危害較為嚴(yán)重的病害之一。黃矮病由病毒引起,可導(dǎo)致小麥葉片變黃、植株矮化、產(chǎn)量下降,給小麥生產(chǎn)帶來巨大損失。培育和利用抗黃矮病小麥品種是解決該問題經(jīng)濟(jì)有效的途徑,而鑒定和篩選抗黃矮病小麥新種質(zhì)則是抗病育種的基礎(chǔ)。

傳統(tǒng)的小麥抗黃矮病鑒定方法主要依靠田間自然發(fā)病調(diào)查和人工接種鑒定,這些方法雖然直觀,但存在周期長、受環(huán)境影響大、準(zhǔn)確性不高等缺點(diǎn)。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,基因組原位雜交技術(shù)(Genomic in situ hybridization, GISH)因其能夠在染色體水平上直接檢測外源染色體或染色體片段,為小麥新種質(zhì)的鑒定提供了精準(zhǔn)、高效的手段。

威尼德 HB-500 原位雜交儀作為分子病理研究領(lǐng)域的先進(jìn)設(shè)備,具備精準(zhǔn)控溫、高效操作和智能互聯(lián)等優(yōu)勢。其搭載的糊 PID 智能算法與熱蓋控溫技術(shù),可實(shí)現(xiàn) 12 張玻片全域溫差≤±1℃,為原位雜交實(shí)驗(yàn)提供了穩(wěn)定的溫度環(huán)境,杜絕了因溫度波動導(dǎo)致的假陰性 / 陽性風(fēng)險。全密封濕度控制系統(tǒng)能精準(zhǔn)鎖水防揮發(fā),確保核酸探針高效結(jié)合,提升實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重現(xiàn)性。此外,該儀器的極簡操作設(shè)計和智能互聯(lián)功能,大大縮短了實(shí)驗(yàn)流程,提高了實(shí)驗(yàn)效率,為科研人員提供了便利。本研究旨在利用基因組原位雜交技術(shù),結(jié)合威尼德 HB-500 原位雜交儀,對小麥新種質(zhì)進(jìn)行抗黃矮病鑒定,明確其染色體組成及外源染色體來源,為小麥抗病育種提供優(yōu)異的種質(zhì)資源。

二、材料與方法

(一)實(shí)驗(yàn)材料

抗黃矮病小麥新種質(zhì):由本實(shí)驗(yàn)室通過雜交和誘變等方法創(chuàng)制,在田間表現(xiàn)出良好的抗黃矮病特性。

普通小麥品種:作為對照材料,選用當(dāng)?shù)貜V泛種植的小麥品種。

簇毛麥(Dasypyrum villosum):一種具有抗黃矮病基因的近緣物種,用于制備探針。

(二)主要試劑

實(shí)驗(yàn)中使用的試劑包括某試劑(用于基因組 DNA 提取、探針標(biāo)記、雜交緩沖液配制等)、氯化鈉、檸檬酸鈉、甲酰胺、硫酸葡聚糖、鮭魚精 DNA 等。所有試劑均為分析純,購自正規(guī)試劑供應(yīng)商。

(三)主要儀器

威尼德 HB-500 原位雜交儀(具備精準(zhǔn)控溫、全自動變性與雜交一體化功能,7 英寸智能觸控屏,支持 110 組用戶程序自由編程)、高速冷凍離心機(jī)、恒溫培養(yǎng)箱、顯微鏡(配備熒光檢測系統(tǒng))、移液器、水浴鍋等。

三、實(shí)驗(yàn)方法

(一)基因組 DNA 提取

分別提取抗黃矮病小麥新種質(zhì)、普通小麥品種和簇毛麥的基因組 DNA。采用改良的 CTAB 法,具體步驟如下:

取新鮮葉片 0.5g,置于研缽中,加入液氮研磨至粉末狀。

將粉末轉(zhuǎn)移至 1.5mL 離心管中,加入 600μL 預(yù)熱至 65℃的 CTAB 提取緩沖液(含 2% CTAB,1.4M NaCl,20mM EDTA,100mM Tris-HCl,pH 8.0,0.2% β- 巰基乙醇),輕輕混勻,于 65℃水浴中保溫 30min,期間不時顛倒混勻。

加入等體積的氯仿 - 異戊醇(24:1),輕輕顛倒混勻,室溫下 12000rpm 離心 15min。

將上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中,加入 2/3 體積的異丙醇,輕輕顛倒混勻,室溫下靜置 10min,12000rpm 離心 10min,棄上清。

用 70% 乙醇洗滌沉淀 2 次,室溫晾干,加入 50μL TE 緩沖液(含 10mM Tris-HCl,pH 8.0,1mM EDTA)溶解 DNA,置于 - 20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

(二)探針制備

以簇毛麥基因組 DNA 為模板,采用缺口平移法標(biāo)記探針。具體步驟如下:

在離心管中依次加入簇毛麥基因組 DNA(1μg/μL)2μL、dNTP 混合液(含 dATP、dCTP、dGTP 各 0.5mM,dTTP 0.2mM,生物素 - 16-dUTP 0.3mM)2μL、10× 缺口平移緩沖液 2μL、DNA 酶 I(1U/μL)0.5μL、DNA 聚合酶 I(5U/μL)0.5μL,加無菌水至 20μL。

輕輕混勻,于 15℃水浴中反應(yīng) 2-3h。

加入 2μL 0.5M EDTA(pH 8.0)終止反應(yīng),然后加入 2μL RNase A(10mg/mL),37℃保溫 30min。

加入等體積的酚 - 氯仿 - 異戊醇(25:24:1),混勻后 12000rpm 離心 10min,將上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中。

加入 1/10 體積的 3M 乙酸鈉(pH 5.2)和 2.5 倍體積的無水乙醇,-20℃靜置 30min,12000rpm 離心 15min,棄上清。

用 70% 乙醇洗滌沉淀,室溫晾干,加入 50μL TE 緩沖液溶解探針,置于 - 20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

(三)染色體標(biāo)本制備

根尖預(yù)處理:選取生長旺盛的小麥根尖,用 0.002M 的 8 - 羥基喹啉溶液在室溫下處理 3-4h,以抑制細(xì)胞分裂,使染色體縮短變粗。

固定:將預(yù)處理后的根尖用卡諾固定液(甲醇:冰醋酸 = 3:1)固定 24h,然后轉(zhuǎn)移至 70% 乙醇中,4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

解離:將固定后的根尖放入 1M 鹽酸中,60℃水浴解離 10-15min,至根尖軟化為止。

漂洗:用蒸餾水漂洗根尖 3 次,每次 5min,去除鹽酸。

壓片:將根尖放在載玻片上,滴加一滴蒸餾水,用鑷子將根尖搗碎,蓋上蓋玻片,用橡皮錘輕輕敲擊蓋玻片,使細(xì)胞分散,然后在酒精燈上輕微加熱,迅速冷卻,使染色體固定在載玻片上。

(四)原位雜交

玻片處理:將制備好的染色體標(biāo)本玻片置于威尼德 HB-500 原位雜交儀中,進(jìn)行預(yù)處理。首先在 70℃下烘烤 2h,以增強(qiáng)玻片與細(xì)胞的粘附力。然后依次用 2×SSC(含 0.3M NaCl,0.03M 檸檬酸鈉,pH 7.0)在 37℃下處理 10min,70%、85%、100% 乙醇系列脫水,每次 5min,室溫晾干。

探針變性與雜交:將制備好的探針與雜交緩沖液(含 50% 甲酰胺,10% 硫酸葡聚糖,2×SSC,100μg/mL 鮭魚精 DNA)按 1:10 的比例混合,在威尼德 HB-500 原位雜交儀中于 75℃下變性 10min,然后迅速置于冰上冷卻 5min,使探針 DNA 變性為單鏈。將變性后的探針混合液滴加在染色體標(biāo)本玻片上,蓋上蓋玻片,用橡膠泥密封邊緣,防止雜交液揮發(fā)。將玻片放入威尼德 HB-500 原位雜交儀中,設(shè)置雜交程序:先在 42℃下預(yù)雜交 1h,然后在 37℃下雜交 16-20h。威尼德 HB-500 原位雜交儀的精準(zhǔn)控溫功能確保了雜交過程中溫度的穩(wěn)定,其全密封濕度控制系統(tǒng)有效防止了雜交液的揮發(fā),保證了核酸探針與染色體 DNA 的高效結(jié)合。

洗片:雜交結(jié)束后,去除蓋玻片,將玻片依次放入 2×SSC(37℃,5min)、1×SSC(37℃,10min)、0.5×SSC(37℃,10min)中洗片,每次洗片時輕輕晃動玻片,以去除未結(jié)合的探針。最后用蒸餾水漂洗玻片 1 次,室溫晾干。

(五)信號檢測與觀察

信號檢測:在晾干的玻片上滴加熒光素標(biāo)記的親和素(1:1000 稀釋于 1×PBS 中),室溫下孵育 30min,然后用 1×PBS 洗片 3 次,每次 5min。為了增強(qiáng)信號,可進(jìn)行生物素 - 親和素放大系統(tǒng)處理,即滴加生物素化的抗親和素抗體(1:1000 稀釋于 1×PBS 中),室溫下孵育 30min,再用 1×PBS 洗片 3 次,每次 5min,最后滴加熒光素標(biāo)記的親和素(1:1000 稀釋于 1×PBS 中),室溫下孵育 30min,1×PBS 洗片 3 次,每次 5min。

復(fù)染與封片:滴加 DAPI(4',6 - 二脒基 - 2 - 苯基吲哚)染液(1μg/mL),室溫下孵育 10min,對染色體 DNA 進(jìn)行復(fù)染。然后用蒸餾水漂洗玻片 1 次,滴加抗熒光淬滅封片劑,蓋上蓋玻片,避免產(chǎn)生氣泡。

觀察與拍照:將玻片置于顯微鏡(配備熒光檢測系統(tǒng))下,在紫外光激發(fā)下觀察雜交信號。威尼德 HB-500 原位雜交儀確保了雜交信號的清晰和穩(wěn)定,通過顯微鏡可以清晰地看到外源染色體或染色體片段上的熒光信號。使用顯微鏡的拍照系統(tǒng)對典型的雜交信號進(jìn)行拍照記錄,以便后續(xù)分析。

四、結(jié)果與分析

通過基因組原位雜交實(shí)驗(yàn),在抗黃矮病小麥新種質(zhì)的染色體標(biāo)本上觀察到了明顯的熒光信號,表明該新種質(zhì)中含有來自簇毛麥的外源染色體或染色體片段。進(jìn)一步分析顯示,這些外源染色體或染色體片段在小麥染色體組中穩(wěn)定存在,并且與抗黃矮病性狀緊密相關(guān)。與普通小麥品種相比,抗黃矮病小麥新種質(zhì)的染色體組成發(fā)生了明顯變化,外源染色體的導(dǎo)入為其賦予了抗黃矮病的特性。

威尼德 HB-500 原位雜交儀在實(shí)驗(yàn)過程中表現(xiàn)出色,其精準(zhǔn)的控溫功能保證了雜交過程中溫度的均一性,避免了因溫度波動導(dǎo)致的實(shí)驗(yàn)誤差。全自動變性與雜交一體化流程大大簡化了實(shí)驗(yàn)操作,縮短了實(shí)驗(yàn)時間,提高了實(shí)驗(yàn)效率。同時,該儀器的智能互聯(lián)功能使得實(shí)驗(yàn)過程全程透明可控,實(shí)時溫度曲線可視化和數(shù)據(jù)導(dǎo)出功能為實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分析和論文撰寫提供了有力的支持。

五、結(jié)論

本研究應(yīng)用基因組原位雜交技術(shù),成功鑒定出抗黃矮病小麥新種質(zhì),明確了其染色體組成及外源染色體來源。威尼德 HB-500 原位雜交儀在實(shí)驗(yàn)中發(fā)揮了重要作用,其精準(zhǔn)控溫、高效操作和智能互聯(lián)等優(yōu)勢為實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行和結(jié)果的準(zhǔn)確性提供了保障。該研究不僅為小麥抗病育種提供了優(yōu)異的種質(zhì)資源,也為基因組原位雜交技術(shù)在農(nóng)業(yè)科研中的應(yīng)用提供了成功范例。

威尼德 HB-500 原位雜交儀作為分子病理研究領(lǐng)域的先進(jìn)設(shè)備,適用于基因定位、疾病診斷、農(nóng)業(yè)與生態(tài)學(xué)等多個領(lǐng)域的研究。其性能和便捷的操作將為科研人員帶來全新的實(shí)驗(yàn)體驗(yàn),助力科研工作者在生命科學(xué)領(lǐng)域取得更多的突破。如果您對威尼德 HB-500 原位雜交儀感興趣,歡迎立即咨詢,解鎖精準(zhǔn)科研力,獲取預(yù)約免費(fèi)樣機(jī)演示機(jī)會。

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