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倒置顯微鏡是為了適應生物學、醫學等領域中的組織培養、細胞離體培養、浮游生物、環境保護、食品檢驗等顯微觀察。由于這些活體被檢物體均放置在培養皿(或培養瓶)中，這樣就要求倒置顯微鏡的物鏡和聚光鏡的工作距離很長，能直接對培養皿中的被檢物體進行顯微觀察和研究。因此，物鏡、聚光鏡和光源的位置都顛倒過來，故稱為“倒置顯微鏡”。
倒置熒光顯微鏡，是指與一般顯微鏡相比，其物鏡、聚光鏡和光源的位置都顛倒過來，由熒光附件與顯微鏡有機結合構成的顯微鏡。主要用于細胞等活體組織的熒光、相差觀察。
倒置熒光顯微鏡的操作步驟：
1、倒置熒光顯微鏡中常用的觀察方法就是相差。由于這種方法不要求染色，是觀察活細胞和微生物的理想方法。在此提供各種聚光器來滿足需要，這種方法提供帶有自然背景色的、高對比度的、高清晰度的圖像。
2、開機，接連倒置熒光顯微鏡電源，打開鏡體下端的電控開關。
3、使用
①準備：將待觀察對象置于載物臺上。旋轉三孔轉換器，選擇較小的物鏡。觀察，并調節鉸鏈式雙目目鏡，舒適為宜。
②調節光源：推拉調節鏡體下端的亮度調節器至適宜。通過調節聚光鏡下面的光柵來調節光源的大小。
③調節像距：轉三孔轉換器，選擇合適倍數的物鏡;更換并選擇合適的目鏡;同時調節升降，除或減小圖像周圍的光暈，提高了圖像的襯度。
④觀察：通過目鏡進行觀察結果;調整載物臺，選擇觀察視野。
4、關機
取下觀察對象，推拉光源亮度調節器至暗。關閉倒置熒光顯微鏡的開關，并斷開電源。旋轉三孔轉換器，使物鏡鏡片置于載物臺下側，防止灰塵的沉降。
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