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單細胞測序“加速器“:瑞孚迪,讓功能基因組學研究更快一步!

2024-10-16  閱讀(196)

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單細胞測序技術被廣泛的應用于功能基因組學研究中,為了探究基因組的動態表達、調控機制以及這些機制如何影響生物體的表型,通過單細胞測序更深入地了解細胞間的異質性,揭示在生物體發育、疾病進展過程中單個細胞所扮演的關鍵角色,對于理解人類疾病的發生機制、開發新的治療方法以及推動精準醫療的發展具有重要意義。


然而單細胞測序技術作為工具去使用并不容易,要經過單細胞懸液制備,細胞活力質控,單細胞標簽,mRNA逆轉錄,cDNA擴增、文庫制備等一系列操作后才能進入測序環節,這些過程且相當復雜,對操作人員的專業水平要求高,如何建立自動化標準化流程、穩定輸出高質量文庫仍然是個難題。





瑞孚迪(Revvity)專注于自動化技術30余年,在測序樣本前處理全流程自動化的解決方案上已大有所成。現在我們進一步結合公司在細胞成像、核酸檢測、文庫構建等優勢產品,為功能基因組研究中的單細胞測序領域貢獻力量。


單細胞懸液制備


Omni Bead Ruptor珠磨均質儀可以解決單細胞測序制備程的第一步---單細胞懸液制備。它是一個多功能的臺式設備,其載架運動模式設計有助于樣本解離。加上優化的解離管,樣本可被均勻地分解成高活力的單細胞懸浮液。


組織樣本可簡單的放入組織解離管中進行分解,該解離管經優化設計。

設備可同時容納多達12個解離管,組織分解方法經過充分的技術驗證。




通過使用我們的樣品分解技術優化您的單細胞分離方案,以取代傳統的手動制備方法,不僅提高了通量和速度,更關鍵的,提高您獲得優質結果的信心!


細胞質控


精確的細胞計數和活率評估對于單細胞測序至關重要。瑞孚迪細胞計數儀以其先進的硬件設計、智能化的軟件識別,結合定制試劑與耗材,為細胞定量提供快速有效的方法,可從復雜混亂的樣本中精準識別和定量目標細胞群,用于單細胞測序文庫制備前對細胞的質量控制。





Cellaca MX和Cellometer Ascend細胞計數儀特點:

精確定量細胞

排除無核雜質

低樣品量消耗

靈活通量選擇

瑞孚迪細胞計數平臺配套有全面的試劑、耗材和標準微珠。


文庫制備


瑞孚迪擁有一套測序前樣本制備與質控的全流程解決方案。在文庫制備環節,我們最新開發了一款專屬機型---Fontus NGS,專門應用于NGS文庫制備。在單細胞測序的文庫構建工作中,自動化建庫儀發揮舉足輕重的作用,無論是形成微滴法 (Droplet) 還是微孔法 (Microwell) ,單細胞被標簽后,都是要進行逆轉錄、cDNA擴增與純化、文庫構建等制備操作,這些既關鍵又費時費力的工作都可以在單細胞文庫構建儀上輕松完成。





Fontus單細胞文庫構建儀為不同通量要求提供兩個機型,24通量和96通量,均可實現全流程自動化,包括溫控、PCR擴增純化等。

不同的單細胞測序平臺的樣本制備流程也不同,Fontus預置了幾大主流單細胞測序平臺的自動化程序方案(經廠家驗證),實現了開箱即用,同時強大的廠家技術服務可支持新自動化方法開發。


DNA和RNA質控


LabChip GX Touch 核酸分析儀使用基于芯片的微流控技術,DNA和RNA的定量和片段大小可以在幾秒鐘內完成。小于150 nL的樣品用于片段尺寸和濃度分析,生成高分辨率的、可重復的數據。


LabChip微流控技術使凝膠電泳現代化。

全自動樣本檢測分析最快可達30秒。

提供RNA和DNA樣本完整性量化指標,質量評分。



數字化數據格式,便于分析、審查、共享和存檔。

不同通量選擇:處理通量1-24個樣品的型號使用靈活,節約時間;處理通量1-384個樣品的型號適用于高通量工作流程。


我們以Fontus單細胞建庫儀為例詳細說明其特點








我們以市面上常見的微滴法 (Droplet) 單細胞轉錄組測序工作流程舉例展示瑞孚迪的組合產品





文庫結果表現


表1:使用瑞孚迪建庫儀對24個單細胞油包水后樣本進行建庫的濃度結果






使用瑞孚迪建庫儀構建的文庫用LabChip質控儀檢測片段大小


瑞孚迪產品組合加速單細胞測序流程,助力功能基因組學研究。每個工作環節皆有多款設備可供選擇,其中自動化建庫儀有幾個款式可選,均可實現單細胞測序從RNA反轉錄開始到文庫建好的自動化流程。不同配置的選擇、不同通量的選擇,讓用戶可以自由的選擇適合自身需求的設備,標準化的操作精準度、均一穩定的結果輸出,讓您在解放雙手的同時建立實驗保障的信心。


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