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EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒:快速高效的研究體內DNA-蛋白質相互作用

時間:2024/12/16閱讀:107
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在體內富集組蛋白或轉錄因子(TF)復合DNA,然后進行qPCR/或下一代測序,為研究全基因組蛋白質-DNA相互作用提供了有利的工具。通常用于實現這一目標的主要方法是染色質免疫沉淀,然后進行測序(ChIP-seq)。該方法包括高度特異的ChIP-exoChIP-nexus。這兩種分析提供了高分辨率的繪圖。然而,這些檢測的主要局限性在于,它們需要大量的輸入材料、細胞或組織才能在背景噪聲中產生足夠強的信號。CUT&RUN(靶下切割和核酸酶下釋放)是為繪制蛋白質與DNA與有限生物材料的相互作用而開發的,這需要更少的樣品量,也顯著提高了繪制分辨率。然而,該測定的一個相當大的缺點是抗體未偶聯的pAG-MNase的非特異性切割,顯著限制了CUTRUN對不同物種和細胞/組織類型中大多數轉錄因子的特異性。此外,原始的CUT&RUN步驟復雜,需要優化測定條件,這仍然很耗時。

 

艾美捷EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒

貨號:P-2035-24

輸入類型:細胞、組織

研究領域:染色質與轉錄

目標應用:蛋白質-DNA富集

容器格式:管

 保證:6個月

 

EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒組成:

11.png

*使用前將溶液旋轉到底部。

 

EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒檢測原理:

EpiNext™ CUT&LUNCH(目標下切割并均勻釋放D特核酸復合物)試劑盒提供了一種快速高效的方法來研究體內DNA-蛋白質相互作用。它整合了ChIPCUT&RUN的所有優勢,同時有效解決了它們的局限性。

 

EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒具有以下優點和特點:

極快速的三步協議:直接從完整的細胞開始,無需ConA固定。程序可以在1小時50分鐘內完成,最小化核損傷和染色質損失,同時保持天然染色質結構。

增強的特異性和最小化的背景:D特的核酸切割酶通過選擇性地在目標蛋白/DNA復合物兩端切割DNA,確保低序列偏差,不影響與蛋白質結合的DNA。非特異性蛋白-DNA復合物被選擇性消除,實現目標蛋白富集區域的高分辨率映射。

低輸入材料:在最短時間內完成強大的未結合DNA切割和免疫捕獲。這種方法同時使用細胞和組織,同時提供目標蛋白的最大降解保護和最小樣本損失。因此,輸入的細胞數量可以少至500個細胞。

廣泛的適用性:適用于各種物種的培養細胞以及新鮮或冷凍組織,與組蛋白和轉錄因子兼容,同時保持檢測的特異性和靈敏度。

高度便捷:試劑盒包含所有必要的組分,使EpiNext™ CUT&LUNCH檢測試劑盒既方便又經濟。

與現有流程的無縫集成:用于NGS的富集DNA可以與現有的、經過時間考驗的ChIP-seq生物信息學軟件和工具一起分析。

 

EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒保存建議

該試劑盒分兩部分運輸:第一部分在室溫下,第二部分在4°C的冷凍冰袋上。

收到后,根據上表中的溫度避光儲存組件。

注:使用前檢查WB(清洗緩沖液)和PB(透化緩沖液)是否含有鹽沉淀。 如果是這樣,請在室溫或37°C下短暫加熱并搖晃,直至鹽重新溶解。

試劑盒的所有組分在適當儲存的情況下,自裝運之日起可穩定儲存6個月

 

 

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