一、通道數選擇：實驗需求與擴展性的平衡
基礎需求匹配
單通道至四通道：適用于常規基因表達分析、病原體檢測（如新冠、HPV分型），例如LightCycler96的四通道設計可覆蓋FAM/VIC/ROX/Cy5等常用染料組合。
五通道及以上：支持高復雜度多重PCR（如同時檢測5種以上靶標），需結合儀器是否支持卡夾式光路設計（如QuantStudio™5的6通道系統，可通過擴展卡夾實現通道升級）。
未來擴展性
選擇模塊化通道設計（如Bio-RadCFX96的4通道系統），避免一次性投入過高成本。
優先選擇兼容主流熒光染料（FAM/HEX/ROX/Cy5）的儀器，減少染料適配成本。
二、檢測靈敏度：核心參數與實驗場景的適配
靈敏度指標
單拷貝檢測能力：如Archimed系列可檢測1拷貝基因，適用于低豐度靶標（如ctDNA、病毒載量監測）。
分辨率：1.33倍至1.5倍的拷貝數差異檢測能力，滿足腫瘤MRD評估、基因突變篩查等高精度需求。
靈敏度優化技術
溫控系統：±0.25℃的溫控精度（如QuantStudio™5）可減少非特異性擴增，提升低濃度樣本信號穩定性。
光學系統：采用菲涅爾透鏡或高強度固態光源（如LightCycler96的白光LED），增強熒光信號采集效率。
三、選型決策樹
常規實驗：四通道+單拷貝靈敏度（如LightCycler96），覆蓋基因表達、SNP分型。
復雜多重PCR：五通道及以上+高分辨率（如QuantStudio™5），支持腫瘤多靶標檢測。
超敏檢測：六通道+單拷貝靈敏度（如Archimed系列），適用于液體活檢、病原體低載量監測。
結論：選型需結合實驗復雜度、樣本豐度及預算，優先選擇通道可擴展、靈敏度可驗證的儀器，并通過預實驗驗證實際性能。
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