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新品預告 | cfDNA和FFPE DNA提取試劑盒即將上線！
MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit
cfDNA是指在循環(huán)血中，游離于細胞外的部分降解了的機體內源性 DNA，因其在疾病診斷和檢測如液體活檢，NIPT等方面的巨大潛力，相關的研究和實驗在臨床中應用日益廣泛，且發(fā)展極其迅速。cfDNA在健康成年人中濃度大約只有10~30 ng/mL，且片段僅有170 bp左右。從樣本采集運輸，到血漿獲取，再到樣本裂解、捕獲、清洗、洗脫，最后到下游應用，每一步都有巨大的挑戰(zhàn)。
MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit適用于從1-5mL的血漿、血清樣本中的提取高質量cfDNA，操作簡單、快速。本產品采用*的磁珠和精心優(yōu)化的緩沖體系，可最大限度的純化回收游離DNA。提取的核酸產量高，質量穩(wěn)定可靠，最大限度的去除蛋白等其他抑制物，適用于各種下游應用實驗，如熒光定量PCR和二代測序等，兼容手動提取和自動提取流程。
產 品 特 點
◎ 提取質量高: 總量,純度均較高,滿足后續(xù)建庫要求；
產 品 優(yōu) 勢
◎ 提取總量優(yōu)異
以1 mL人血漿為樣本，YEASEN提取總量好于競品N，其組內穩(wěn)定性優(yōu)于競品Q。
圖1. 各試劑盒提取cfDNA結果
◎ 抑制性殘留物少
qPCR擴增TERT基因，競品Q（藍色）、YEASEN（橙色）、競品N（綠色），與競品相比，YEASEN擴增曲線無顯著差異，表明YEASEN提取試劑盒可獲得較為純凈，無擴增抑制物殘留的cfDNA。
圖2. TERT基因qPCR結果
圖3. TERT基因qPCR擴增Ct值
◎ 文庫產量高
取1ng cfDNA，采用建庫試劑盒Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit for Illumina®（12201ES08），PCR循環(huán)數(shù)=14進行建庫，文庫取2μL電泳，與競品相比，YEASEN產量及文庫大小無差異，性能較為優(yōu)異。
圖4. 1ng cfDNA建庫結果
圖5. 1ng cfDNA建庫后文庫大小分布
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產品名稱 | 產品編號 | 規(guī)格 |
MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit | 18381ES50 | 50 T |
MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit
腫瘤組織幾乎是病人愿意被切下來的組織，也是疾病回顧性研究的最佳研究對象。但受限于醫(yī)院的保存條件，臨床離體的組織容易喪失原有正常的結構和功能。使用福爾馬林固定石蠟包埋處理的樣本（Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded，F(xiàn)FPE）可以在常溫保留很久，所以FFPE就成了醫(yī)院里常用的樣本。但福爾馬林的固定容易使組織中的核酸發(fā)生降解以及導致和分子間的交聯(lián)，因而從石蠟切片中提取出高質量核酸是腫瘤基因檢測領域大大的難題。
MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit脫蠟過程不涉及有毒試劑，采用精心優(yōu)化的緩沖體系，可最大限度的分離純化高純度DNA。提取的核酸純度高，質量穩(wěn)定可靠，適用于各種下游應用實驗，如酶切、PCR、RT-qPCR等。
產 品 特 點
◎ 安全無毒：采用無毒性脫蠟液脫蠟，不涉及二甲苯等有機試劑；
產 品 優(yōu) 勢
◎ 提取質量高
以10mg小鼠石蠟包埋組織為樣本，100μL洗脫，與競品相比，YEASEN提取產量無明顯差異。其中磁珠法總量、純度整體優(yōu)于競品Q和競品T。
圖6. 各試劑盒 提取FFPE DNA結果
表1. 各試劑盒提取FFPE DNA純度
試劑盒 | 260/280 | 260/230 |
Q-離心柱 | 2.04 | 2.30 |
2.01 | 2.24 | |
T-離心柱 | 1.98 | 2.34 |
1.99 | 2.39 | |
YEASEN-離心柱 | 2.03 | 2.04 |
2.00 | 2.32 | |
YEASEN-磁珠 | 1.98 | 2.30 |
1.98 | 2.31 |
◎ 抑制性殘留物少
電泳擴增內參Gapdh基因，內參擴增無顯著差異，抑制性產物少，整體提取質量較優(yōu)。
圖7. 提取DNA中Gapdh基因擴增
◎ 建庫性能優(yōu)
取50ng FFPE DNA，采用建庫試劑盒Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina®（12205ES08），PCR循環(huán)數(shù)=7進行建庫，文庫進行電泳，分析發(fā)現(xiàn)，與競品相比，YEASEN產量及文庫大小無異常，其中YEASEN磁珠法優(yōu)于競品。.
圖8. 50ng FFPE DNA建庫結果
圖9. FFPE DNA建庫后片段大小分布
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產品名稱 | 產品編號 | 規(guī)格 |
MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit | 18371ES60 | 50 T |
