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創新酶切法試劑盒:打造高效建庫,消除假陽性!

2024-5-6  閱讀(240)

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NGS,即下一代測序技術,是近年來基因測序領域的一次重大突破。相較于傳統的測序方法,NGS具有高通量、高準確性、低成本等諸多優勢,使得基因測序變得更加高效和便捷。通過NGS技術,科學家們能夠更深入地了解基因組的結構和功能,為疾病診斷、治療以及新藥研發等領域提供了強有力的支持。

 


 

酶切法建庫:NGS的得力助手

在NGS的研究中,建庫是一個至關重要的環節。建庫的質量直接影響到測序結果的準確性和可靠性。而酶切法建庫,避免了傳統的機械打斷,無需打斷儀,流程簡便,可同時處理多個樣,更適合于自動化建庫,滿足大規模基因組研究的需求,是目前應用廣泛的建庫方法之一。

酶切法建庫有其優勢,但是也有其劣勢,比如:酶切偏好性、引入假陽性、起始量適用范圍窄等,翌圣借助ZymeEditor(點擊了解更多)酶改造及發酵純化工藝平臺,對酶進行進化改造,及不斷優化的反應體系,克服了酶切法建庫方法學上的局限性,讓酶切法建庫更精準更快速!

 

 

 
產品介紹
 

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3(Cat#12194)

 

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3 是一款可用于Illumina®和MGI®高通量測序平臺的新一代酶切法建庫試劑盒。本試劑盒將片段化模塊與末端修復模塊合二為一,極大的降低了建庫的時間和成本、連接模塊的酶和buffer預混,簡化了操作流程,更加適合于自動化建庫。

 

 

 

實驗原理

 

圖1.酶切法建庫原理

 

 

 

產品優勢

 
 

高效穩定的片段化效果

 
 

以不同質量等級的FFPE DNA樣本建庫,樣本投入量100 ng,采用同一酶切條件4℃ 1 min,37℃10 min,72℃ 20 min,4℃ hold,文庫主峰在300 bp左右;數據顯示不同降解程度的FFPE樣本同一酶切條件下,文庫主峰基本一致

 

FFPE DNA質量等級

A

B

C

D

文庫產量ng

2550

2470

1760

1790

文庫主峰bp

295bp

301bp

288bp

278bp

 

圖2.FFPE DNA的酶切文庫峰圖

 

 

高效穩定的片段化效果

 
 

Human gDNA為模板,以不同的樣本投入量,12194與競品W試劑盒相比,12194的文庫產量與競品相當。數據顯示不同投入量文庫產量對比,12194有高效的文庫轉化效率

 

 

 

極低的假陽性率

 
 

NGS建庫引入的假陽性問題主要包括嵌合序列和堿基錯摻等因素,在酶切法片段化時將會引入一些假的嵌合序列,12194對片段化酶全面升級,解決了酶切假陽性的痛點。

 

用12194酶法片段化建庫試劑盒對3種標準品樣本(FFPE標準品、gDNA標準品、ctDNA標準品)建庫,并和競品W進行了頭對頭的比較。數據顯示,無論是FFPE樣本、gDNA、還是ctDNA,12194的Soft Clip、false chimeric都低于或近似于競品W

 

圖4.12194與競品W的數據質量對比

 

 

優異的位點檢出率

 
 

用12194和競品W建庫雜交捕獲測序對比,模板類型為腫瘤SNV 5% gDNA標準品GW-OGTM006和腫瘤gDNA野生型標準品GW-OGTM005,將突變位點稀釋為 0.5% 和0.1%,模板投入量100ng,PCR擴增循環數為7,捕獲panel為何因Cancer SLC Panel,平均測序深度為5000×,比較捕獲測序數據。數據顯示12194對突變位點檢出率與目標檢出率一致。

 

圖5.12194與競品W的低頻位點檢出率

 

 

 

產品訂購指南

 

產品名稱

產品貨號

產品規格

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3一步法DNA建庫試劑盒V3

12194ES08

8 T

12194ES24

24 T

12194ES96

96 T

 

 

 

相關產品推薦

 

產品應用

產品名稱

產品編號

FFPE提取

MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit 磁珠法FFPE DNA提取試劑盒V2

18375ES

機械法建庫

Hieff NGS® DNA Library Prep Kit 全能型DNA建庫試劑盒 

13577ES

FFPE 修復試劑

Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent

12606ES

 

歡迎大家根據自己的實驗需要進行測試和訂購。如果對產品有疑問或是測試結果的反饋,可聯系對應區域內的技術支持或銷售同事,會為您提供專業的支持和服務。

 



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