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15 min不一定能追到一個女朋友,但一定可以完成一次克隆!

2021-7-31  閱讀(650)

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Yeasen Hieff Clone® 一步法克隆試劑盒榮登《Cell》《Science》等國際頂尖期刊

提起“分子克隆"或“載體構建"這兩個詞,大家可能最先想到的是傳統酶切酶連法,即用限制性內切酶產生黏性末端,通過T4 DNA連接酶連接兩個片段的克隆方法。該方法存在著一些明顯的局限,如連接反應時間長,操作繁瑣,克隆效率低,酶切位點的選擇易受到限制等

為了提高克隆效率,節省反應時間,基于同源重組酶的無縫克隆技術應用而生。與傳統酶切酶連技術相比無縫克隆技術操作簡單快速,不受到酶切位點的限制,可一次進行多個片段的拼接,大大的提高了克隆效率。

生物在成熟的工具酶表達純化平臺基礎上,獲得高純度重組酶,并反復優化重組酶反應微環境,研發出Hieff Clone®系列無縫克隆試劑盒

Hieff Clone®克隆試劑盒可以將PCR產物定向克隆至任何載體的任何位點,可高效克隆50 bp-10 kb片段。將載體線性化,并在插入片段正、反向PCR引物5'端引入15-25 bp的線性化載體末端同源序列,使得插入片段PCR產物5'3'末端分別帶有與線性化載體兩末端對應的*一致的序列。PCR產物和線性化載體在重組酶的作用下,僅需50℃反應15-20 min即可進行轉化,完成定向克隆,克隆陽性率可達95%以上。



產品優勢



無需考慮酶切位點:不受插入片段酶切位點的限制,適用于任何載體;插入片段兼容粘性或平末端。

?  設計簡單:在插入片段的PCR擴增引物5'端引入20 bp左右與載體末端同源的序列即可。

?  快速高效:50℃,20 min即可完成重組反應。克隆陽性率可達95%以上。

?  應用廣泛:可用于單片段或多片段定向克隆高效克隆50 bp-10 kb片段;也可結合Canace高保真酶,應用于定點突變。




實驗操作流程



?  線性化載體的制備:酶切或PCR制備線性化載體

?  插入片段的制備:在目的DNA片段上下游引物的5'端引入15-25 bp左右載體末端同源序列;PCR反應擴增目的片段。

?  重組反應:按比例混合線性化載體和目的DNA片段進行重組,50℃反應15-20 min。

?  轉化、涂板:將重組產物直接轉化后涂平板,陽性克隆鑒定


1:Hieff Clone®一步法快速定向克隆試劑盒進行單片段和多片段克隆實驗流程圖。




實驗數據



? 單片段高效重組

2:Hieff Clone® One Step Cloning Kit可以有效克隆不同長度的單片段基因。

A-D:重組轉化平板。E:插入片段和載體濃度檢測電泳圖。F-H:插入片段PCR鑒定電泳圖。箭頭指示目的條帶。載體:pFastBac1,4.7 kb,插入片段大小分別是1.2 kb,3 kb和5 kb,載體與插入片段摩爾比:1:3,重組反應條件:50℃,20 min。

? 多片段輕松重組

3:Hieff Clone® Plus Multi One Step Cloning Kit進行三片段克隆。

A:重組轉化平板。B:插入片段和載體濃度檢測電泳圖。C:PCR方法鑒定每個單片段和最終連接基因。箭頭指示目的條帶。載體:pCAMIBA1302,10 kb,三個插入片段長度:1 kb,1.5 kb和2.5 kb,重組反應條件:50℃,20 min。



客戶反饋



?  長片段重組

實驗信息:載體大小:8000 bp,目的片段大小:7500 bp。

實驗數據:

寶5.jpg

5:使用Hieff Clone® Plus One Step Cloning Kit進行克隆。

A:陰性對照轉化平板。B:重組質粒轉化平板。C:載體和目的片段的濃度檢測電泳圖。D:菌落PCR鑒定電泳圖,箭頭指示目的條帶。 M1Marker Ⅲ;M2100 bp DNA ladder。(仁濟醫院)

?  多片段重組
實驗信息:
載體大小:3996 bp;四個片段大小:576 bp,867 bp,915 bp和647 bp。

實驗數據:

寶6.jpg

6:使用Hieff Clone® Multi One Step Cloning Kit進行克隆。

A:重組質粒轉化平板。B:1為載體酶切后瓊脂糖凝膠電泳圖。C:菌落PCR驗證結果,其中1為原始質粒對照電泳,2-5為重組質粒,僅檢測863bp的一個目的片段,6為假陽性。D:陽性克隆測序結果。M:Marker II。(微生物所)



部分發表文獻



[1]. Jiang, Y., et al., Plants transfer lipids to sustain colonization by mutualistic mycorrhizal and parasitic fungi[J]. Science, 2017.IF37.205

[2]. Liu C X, Li X, Nan F, et al. Structure and degradation of circular RNAs regulate PKR activation in innate immunity[J]. Cell, 2019.IF31.398

[3]. Xing, Y.H., et al., SLERT Regulates DDX21 Rings Associated with Pol I Transcription[J]. Cell, 2017. 169(4): p. 664-678.e16. IF31.398

[4]. Wang Y, Hu SB, et al. Genome-wide screening of NEAT1 regulators reveals cross-regulation between paraspeckles and mitochondria[J]. Nat Cell Biol. 2018 Oct;20(10):1145-1158.IF 20.46)  

[5]. Li X., et al., Coordinated circRNA Biogenesis and Function with NF90/NF110 in Viral Infection[J]. Mol Cell. 2017 Jul 20;67(2):214-227.e7.IF14.548

[6]. Yao R W, Xu G, Wang Y, et al. Nascent Pre-rRNA Sorting via Phase Separation Drives the Assembly of Dense Fibrillar Components in the Human Nucleolus[J]. Molecular cell, 2019.IF14.548

[7]. Wu P, Zhang T, Liu B, et al. Mechano-regulation of peptide-MHC class I conformations determines TCR antigen recognition[J]. Molecular cell, 2019, 73(5): 1015-1027. e7.IF14.548

[7]. Qiao HH, Wang F, et al. An ef?cient and multiple target transgenic RNAi technique with low toxicity in Drosophila[J]. Nat Commun. 2018 Oct 8;9(1):4160.IF 12.353

[9]. Gao YQ., et al., A new vesicle trafficking regulator CTL1 plays a crucial role in ion homeostasis[J]. PLoS Biol. 2017 Dec 28;15(12):e2002978.IF9.797

[10]. Du L., et al., Selective oxidation of aliphatic C-H bonds in alkylphenols by a chemomimetic biocatalytic system[J]. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jun 27;114(26):E5129-E5137.IF9.661

[11]. Wang M, Nie Y, Wu X L. Extracellular heme recycling and sharing across species by novel mycomembrane vesicles of a Gram-positive bacterium[J]. The ISME journal, 2020: 1-13.(IF9.493)

[12]. Liu C., et al., Shortened Basal Internodes Encodes a Gibberellin 2-Oxidase and Contributes to Lodging Resistance in Rice[J]. Mol Plant. 2018 Feb 5;11(2):288-299.IF8.827

[13]. Chang Y, Chai B, Ding Y, et al. Overproduction of gentamicin B in industrial strain Micromonospora echinospora CCTCC M 2018898 by cloning of the missing genes genR and genS[J]. Metabolic engineering communications, 2019, 9: e00096.IF7.80810912ES

[14]. Zou G, Bao D, Wang Y, et al. Alleviating product inhibition of Trichoderma reesei cellulase complex with a product-activated mushroom endoglucanase[J]. Bioresource Technology, 2020, 319: 124119.11003ES)(IF7.539

[15]. Ma F, Yang X, Shi Z, et al. Novel crosstalk between ethylene‐and jasmonic acid‐pathway responses to a piercing–sucking insect in rice[J]. New Phytologist, 2019.IF7.29910912ES

[16]. Liang C, Zhang X, Wu J, et al. Dynamic control of toxic natural product biosynthesis by an artificial regulatory circuit[J]. Metabolic Engineering, 2020, 57: 239-246.(IF7.263)

[17]. Xi J., et al. Mir-29b Mediates the Neural Tube versus Neural Crest Fate Decision during Embryonic Stem Cell Neural Differentiation[J]. Stem Cell Reports. 2017 Aug 8;9(2):571-586.IF6.537

[18]. Li N, Hong T, Li R, et al. Cherry Valley Ducks Mitochondrial Antiviral-Signaling Protein-Mediated Signaling Pathway and Antiviral Activity Research[J]. Front Immunol, 2016,7:377.IF6.4

[19]. An D., et al., AtHKT1 drives adaptation of Arabidopsis thaliana to salinity by reducing floral sodium content[J]. PLoS Genet. 2017 Oct 30;13(10):e1007086.IF6.1

[20]. Wang Z., et al. Red blood cells release microparticles containing human argonaute 2 and miRNAs to target genes of Plasmodium falciparum[J]. Emerg Microbes Infect. 2017 Aug 23;6(8):e75. (IF:6.032) 



FAQ



Q:Hieff Clone®克隆的原理是什么?

A:利用末端同源重組的原理。將任意線性化載體和具有與其兩端20 bp左右同源序列的DNA片段快速定向克隆。

Q:與傳統克隆相比,Hieff Clone®克隆有什么優勢?

A: 1)無需考慮酶切位點:不受插入片段酶切位點的限制,適用于任何載體;插入片段兼容粘性或平末端。

2)設計簡單:在插入片段的PCR擴增引物5'端引入20 bp左右與載體末端同源的序列即可。

3)快速高效:50℃,20 min即可完成重組反應。克隆陽性率可達95%以上。

4)應用廣泛:可用于單片段或多片段定向克隆,也可結合Canace高保真酶,應用于定點突變。

Q:同源序列長度對重組效率的影響?

A:同源序列的長度與克隆數目有相關性,一般同源片段選擇在20 bp左右,可以在15 bp-25 bp范圍內調整。并且選擇盡量避免出現二級結構。

Q:線性化載體和目的片段產物的質量會影響重組反應嗎?

A:線性化載體或目的片段品質較差時會極大影響重組反應,建議割膠回收純化產物。

Q:一步法快速定向克隆試劑盒對感受態細胞有要求嗎?

A:推薦使用轉化效率為108 cfu/μg的感受態細胞。如Yeasen的DH5α(cat NO. 11802ES),TOP⑩(cat NO. 11801ES)等。

Q:線性化載體和目的片段擴增產物的使用量和比例?

A:載體使用量應大于0.01 pmol,推薦使用量0.03 pmol;克隆載體與目的片段摩爾比應在2:1-1:5范圍內,最適1:2-1:3,超過范圍可能會影響克隆效率。

Q:一步法快速定向克隆試劑盒適用實驗有哪些?

A:本試劑盒適用于絕大多數基于常規“酶切-連接"方法的克隆實驗,并且特別適用于其它常規方法難以快速實現的基因多點突變、全基因合成等。

Q:多片段一步法快速定向克隆試劑盒可以用于單片段的克隆嗎?

A:多片段一步法克隆試劑盒可以用于單片段的克隆。但是,單片段克隆試劑盒不建議用于多片段的克隆,重組效率可能會受到影響。

Q:一步法快速定向克隆試劑盒反應溫度是50℃,是否可以在37℃進行反應?

A:一般情況下建議在50℃進行反應。50℃有利于消除DNA的二級結構,同時是Hieff Clone®重組酶的最適反應溫度。37℃反應條件也可以進行重組反應,請根據實驗需要進行優化。





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訂購信息



產品名稱

產品貨號

規格

Hieff Clone® Plus One Step Cloning Kit 一步法快速克隆試劑盒

10911ES08

5 T

10911ES20

20 T

Hieff Clone® Plus  Multi One Step Cloning Kit 多片段一步法快速克隆試劑盒

10912ES08

5 T

10912ES10

10 T



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10148ES10

10 U

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100 U

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500 U

10148ES80

1000 U

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100 μL

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1 mL

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2 × Hieff® Robust PCR Master Mix(With Dye)

10106ES03

1 mL

10106ES08

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GoldBand 1kb DNA ladder

10510ES60*

100T

10510ES80*

10*100T

 


HB210723


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