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上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司
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immaginabiotech代理——上海起發(fā)
immaginabiotech iUDI Plate LACEseq說明書
iUDI Plate LACEseq unique dual index Plate包含用于擴(kuò)增indexed Illumina®兼容NGS文庫的*雙索引PCR引物。這些引物可用于需要TruSeq的LACEseq套件中™可共用的
索引引物。
iUDI Plate LACEseq包含索引PCR引物，并提供多達(dá)24對(duì)*的雙索引，用于復(fù)用多達(dá)24個(gè)樣本。索引的PCR引物預(yù)先分配在96孔PCR板中。每個(gè)雙指數(shù)都有足夠的量，可用于5-10個(gè)反應(yīng)。
所有指標(biāo)均已通過功能驗(yàn)證，可與使用雙通道或四通道化學(xué)進(jìn)行堿基調(diào)用的Illumina測序系統(tǒng)協(xié)同工作。
一般注意事項(xiàng)
A、 最佳做法
•不建議iUDI板LACEseq索引板經(jīng)歷五次以上的凍融循環(huán)。
•使用前，取下蓋子。在室溫下解凍10分鐘，然后將盤子旋轉(zhuǎn)至試管底部的顆粒內(nèi)容物。確保板在打開前沒有可見的冷凝水。在使用過程中，請(qǐng)將盤子放在冰上。
•準(zhǔn)備索引PCR時(shí)，使用移液管j端刺穿板的密封，然后直接移取所需體積的索引引物。始終為每口井使用單獨(dú)的吸管頭，以避免指數(shù)交叉污染。使用后再次密封板，以避免溢出。
B、 產(chǎn)品兼容性
iUDI板帶
iUDI板LACEseq板設(shè)計(jì)用于LACEseqTM和PAGExtTM IMMAGINA產(chǎn)品（目錄號(hào)#LS-001和目錄號(hào)#KGE-002）。請(qǐng)參閱LACEseqTM和PAGExtTM試劑盒特定用戶手冊(cè)，了解使用iUDI板中提供的索引PCR引物的說明
LACEseq板。引物對(duì)未甲基化。
C、 多路復(fù)用和解擴(kuò)
重要的是選擇適當(dāng)且符合Illumina推薦兼容性要求的單一索引。LACEseq iUDI引物對(duì)的指數(shù)以四對(duì)為一組進(jìn)行顏色平衡
(1-4, 5-8, 9-12,13-16). 每組四個(gè)索引都是*顏色平衡的，可以合并排序?？梢詮?fù)用的樣本數(shù)少于四個(gè)，但在合并之前要驗(yàn)證顏色平衡。不要跨行共享庫。
我們不建議將Imagina庫與其他供應(yīng)商的庫在同一個(gè)序列通道中進(jìn)行復(fù)用。雖然原則上這是可能的，但可能需要對(duì)索引組合、庫池條件和加載量進(jìn)行特定的優(yōu)化。對(duì)包含不同通道共享的不同庫類型的復(fù)雜池進(jìn)行排序可能會(huì)對(duì)排序運(yùn)行度量、讀取質(zhì)量、讀取輸出和/或解復(fù)用性能產(chǎn)生不可預(yù)測的影響。Imagina對(duì)在同一通道（或運(yùn)行）中與外部庫類型組合排序的Imagina庫的性能更改不承擔(dān)任何責(zé)任。
