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Immudex SARS-CoV-2產(chǎn)品簡(jiǎn)介
SARS 2019冠狀病毒疾病的細(xì)胞CD8+T細(xì)胞直接通過(guò)體外單細(xì)胞RNA(SCRNA)和TCR序列在PBMCs 33例急性COVID19以及六和12個(gè)月后感染。使用HLA-A*01:01、HLA-A*11:01和HLA-A*24:02 MHC-I dCODE Dextramer®試劑檢測(cè)SARS-CoV-2特異性CD8+T細(xì)胞。
在2019冠狀病毒疾病研究中,AdAMO等人使用PCR和細(xì)胞標(biāo)記法結(jié)合PCR和PCR證實(shí)CVID-19患者的轉(zhuǎn)錄因子和T細(xì)胞受體(TCR)序列,研究SARS COV-2特異性長(zhǎng)壽命記憶CD8+T細(xì)胞的特征。
出身背景
急性SARS-COV-2感染中的CD8+T細(xì)胞特征用dCODE Dextramer®S識(shí)別記憶前體。Adamo等人。急性SARS-COV-2感染中的CD8+T細(xì)胞特征識(shí)別記憶前體(2021)BioRxiv(D o i:
研究描述
后果
對(duì)時(shí)間表型變化的scRNAseq分析根據(jù)基因表達(dá)將SARS-CoV-2特異性CD8+T細(xì)胞分為12個(gè)不同的簇(圖1A)。集群1、2和12主導(dǎo)急性期,而集群11主導(dǎo)恢復(fù)期(圖1B)。簇1、2和12對(duì)應(yīng)于細(xì)胞毒性、活化和增殖細(xì)胞,而簇11富含IFN、TNF和LT-α基因。
TCR測(cè)序顯示,持久性克隆的數(shù)量隨著時(shí)間的推移而減少(圖1C),并且這些克隆富含參與IFN-γ應(yīng)答、IFN-α應(yīng)答和TNF信號(hào)傳導(dǎo)的基因。非持久性細(xì)胞富含mTOR信號(hào)基因和與有絲分裂相關(guān)的基因(圖1D)。
結(jié)論
圖1:SARS-CoV-2 CD8+T細(xì)胞的時(shí)間表型轉(zhuǎn)錄變化。A) 對(duì)SARS-CoV-2特異性CD8+T細(xì)胞進(jìn)行的scRNASeq分析顯示,有12個(gè)簇,其中某些簇在急性期或恢復(fù)期占主導(dǎo)地位。B) 通過(guò)TCR測(cè)序確定SARS-CoV-2特異性CD8+T細(xì)胞的克隆型。C) 急性期持久性克隆和非持久性克隆的分布。D) 持續(xù)性和非持續(xù)性SARS-CoV-2 CD8+T細(xì)胞中的基因表達(dá)。
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非典
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冠狀病毒
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2使用dCODE Dextramer®試劑檢測(cè)到的特異性CD8+T細(xì)胞在急性疾病期間表現(xiàn)出特異性表型,表達(dá)與細(xì)胞毒性、活化和增殖細(xì)胞相關(guān)的基因。在恢復(fù)過(guò)程中,在SARS-CoV-2特異性CD8+T細(xì)胞中觀察到記憶性CD8+T細(xì)胞表型的逐步轉(zhuǎn)變,并表達(dá)與IFN、TNF和LT-α相關(guān)的基因
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持續(xù)存在的SARS-CoV-2 CD8+T細(xì)胞克隆隨著時(shí)間的推移而減少,但富含參與IFN-γ反應(yīng)、IFN-α反應(yīng)和TNF信號(hào)傳導(dǎo)的基因