欧美日韩成人在线,337P粉嫩日本亚洲大胆艺术,色综合久久久无码中文字幕波多,麻豆人妻少妇精品无码专区

上海起發實驗試劑有限公司

中級會員·16年

聯系電話

15921799099

您現在的位置: 首頁> 技術文章 > 圖解blast驗證引物教程
中級會員·16年
人:
楊經理
話:
021-50724187 021-50724961
機:
15921799099
真:
021-50724961
址:
上海浦東川沙鎮川沙路6619號上海起發實驗試劑有限公司
化:
www.qfbio.com
址:
www.qfbio.com

掃一掃訪問手機商鋪

圖解blast驗證引物教程

2012-6-10  閱讀(7717)

分享:

http://www.genecool.com/?fromuser=%E6%9D%A8%E5%BB%BA%E8%BE%89

 

    圖解blast驗證引物教程
                  ——以文獻報道的人類的ABCG2的引物為例
                    
2、 點擊Basic BLAST中的nucleotide blast選項
3、 完成2操作后就進入了Basic Local Alignment Search Tool界面
(1)在Enter Query Sequence欄中輸入引物序列:
       注:文獻報道ABCG2的引物為5-CTGAGATCCTGAGCCTTTGG-3;
簡便的做法是同時輸入上下游引物。輸入上下游引物系列都從5’— 3’。 輸入上游引物后,加上≥20個字母n,再輸入下游引物,如下圖:
(2)在Choose Search Set中:
      Database根據預操作基因的種屬定了,本引物可選Human genomic + transcriptOthers (nr etc.)。本人傾向于選后者,覺得此庫信息更多。如下圖:
 
(3)在Program Selection中:選擇Somewhat similar sequences (blastn)項,如下圖:
 
(4)在此界面zui下面:如下圖
Show results in a new window項是顯示界面的形式,可選可不選,在此我們選上了。關鍵要點擊Algorithm parameters參數設置,進入參數設置界面。
 
4. 參數設置:
   (1)在General Parameters中:Expect thresshold期望閾值須改為1000,大于1000也可以;在Word size的下拉框將數字改為7。如下圖:
 
 
(2)Scoring Parameters無須修改
(3)Filters and Masking中,一般來說也沒有必要改
 
5.點擊zui下面一欄的BLAST按鈕,如圖:
 
6.點擊BLAST按鈕后,跳轉出現如下界面:
 
7. 等待若干秒之后,自動跳轉出現顯示BLAST結果的網頁。該網頁用三種形式來顯示blast的結果。
(1)圖形格式:
 
 

會員登錄

×

請輸入賬號

請輸入密碼

=

請輸驗證碼

收藏該商鋪

X
該信息已收藏!
標簽:
保存成功

(空格分隔,最多3個,單個標簽最多10個字符)

常用:

提示

X
您的留言已提交成功!我們將在第一時間回復您~
產品對比 二維碼 在線交流

掃一掃訪問手機商鋪

對比框

在線留言