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幽門螺桿菌耐藥嚴(yán)重 我國發(fā)明藥敏檢驗新方法精準(zhǔn)診療
2022年06月24日 09:54:51 來源:化工儀器網(wǎng) 作者:宋池 點擊量:4728

近日,我國科研團隊研發(fā)了一種單個細(xì)菌細(xì)胞精度、“鑒定-藥敏-溯源”全流程一體化的幽門螺旋菌診療技術(shù)CAST-R-HP。

  【化工儀器網(wǎng) 項目成果】近日,中國科學(xué)院青島生物能源與過程研究所與中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所、青島市立醫(yī)院、青島星賽生物等組成的聯(lián)合團隊以原創(chuàng)的臨床單細(xì)胞拉曼藥敏快檢系統(tǒng)(CAST-R)為基礎(chǔ),研發(fā)了一種單個細(xì)菌細(xì)胞精度、“鑒定-藥敏-溯源”全流程一體化的幽門螺旋菌診療技術(shù)CAST-R-HP。成果發(fā)表于《臨床化學(xué)》。
 
  幽門螺桿菌(Hp)是一種常見的細(xì)菌病原體,主要通過糞-口、口-口、胃-口傳播,與胃炎、消化性潰瘍和胃癌等多種消化道疾病有密切關(guān)系。據(jù)統(tǒng)計,幽門螺桿菌在全球自然人群中的感染率超過50%,同時耐藥嚴(yán)重,導(dǎo)致幽門螺桿菌感染難以根除并且容易復(fù)發(fā)。因此,
 
  建立一個高效的藥敏診斷、治療與溯源體系,研究幽門螺桿菌的耐藥性,對于幽門螺桿菌感染的臨床治療與防控意義重大。
 
  目前,幽門螺桿菌耐藥菌鑒定的臨床金標(biāo)準(zhǔn)是內(nèi)鏡檢查與細(xì)菌培養(yǎng)相結(jié)合的藥敏檢驗。但是這種方法耗時很長:一方面分離和培養(yǎng)胃活檢標(biāo)本中的幽門螺桿菌需要7-10天,另一方面獲得純培養(yǎng)后開展的表型藥敏實驗同樣需要大量時間。另外,這種方法在實驗室中進(jìn)行,無法“原位”對臨床樣品中的病原多樣性進(jìn)行考察。而且只能預(yù)測部分已知耐藥基因的突變,并存在不同程度的假陰性。因此在臨床治療中藥敏檢驗難以推廣,而僅靠經(jīng)驗指導(dǎo)用藥根除感染的失敗率非常高。
 
  研究團隊通過單細(xì)胞拉曼光譜技術(shù)建立了測定代謝抑制程度的幽門螺桿菌藥敏表型快檢技術(shù)CAST-R。團隊首先構(gòu)建了15種臨床常見胃部共生菌的單細(xì)胞拉曼光譜(SCRS)參考數(shù)據(jù)庫,再利用端到端的深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)融合拉曼光譜特征提取與分類模型訓(xùn)練過程以提升病原鑒定準(zhǔn)確率。CAST-R可以直接從臨床胃黏膜樣品出發(fā),識別并鑒定幽門螺桿菌細(xì)胞。根據(jù)實驗結(jié)果,該技術(shù)的檢測準(zhǔn)確率達(dá)98.5±0.27%。
 
  CAST-R還可以用于研究耐藥機制并進(jìn)行全基因組溯源。從臨床樣品中直接識別特定藥敏表型的幽門螺桿菌細(xì)胞,并對其進(jìn)行拉曼分選和核酸擴增,通過基因型驗證藥敏表型。為幽門螺桿菌耐藥性的研究提供了有效手段。
 
  (資料來源:科技日報)
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